โครงสร้างพื้นฐานที่พบทั้งในเซลล์พืชและเซลล์สัตว์ และสามารถสังเกตได้ด้วยกล้องจุลทรรศน์ใช้แสง ได้แก่ เยื่อหุ้มเซลล์ ไซโทพลาซึมและนิวเคลียส โครงสร้างที่พบในเซลล์พืชแต่ไม่พบในเซลล์สัตว์ ได้แก่ ผนังเซลล์และคลอโรพลาสต์ โครงสร้างต่าง ๆ ของเซลล์ มีหน้าที่แตกต่างกัน ดังนี้ ผนังเซลล์ทำหน้าที่ให้ความแข็งแรงแก่เซลล์ เยื่อหุ้มเซลล์ทำหน้าที่ห่อหุ้มเซลล์และควบคุมการลำเลียงสารเข้าและออกจากเซลล์ นิวเคลียสทำหน้าที่ควบคุมการทำงานของเซลล์ ไซโทพลาซึมมีออร์แกเนลล์ที่ทำหน้าที่แตกต่างกัน แวคิวโอลทำหน้าที่เก็บน้ำและสารต่าง ๆ ไมโทคอนเดรียทำหน้าที่เกี่ยวกับการสลายสารอาหารเพื่อให้ได้พลังงานแก่เซลล์ คลอโรพลาสต์เป็นแหล่งที่เกิดการสังเคราะห์ด้วยแสง